Advanced sampling and first-principles molecular dynamics
E. Sevgen, F. Giberti, H. Sidky, J. K. Whitmer, G. Galli, F. Gygi, and J. J. de Pablo J. Chem. Theory Comput. 14, 2881–2888 (2018).
C. Zhang, F. Giberti, E. Sevgen, J. J. de Pablo, F. Gygi and G. Galli Nat. Commun. 11, 3037 (2020).
E. M. Y. Lee, T. Ludwig, B. Yu, A. R. Singh, F. Gygi, J. K. Nørskov, and J. J. de Pablo J. Phys. Chem. Lett. 12, 2954-2962, (2021).
Example: Free energy calculations of a peptide
